4月3日，南京地铁全线网客运量达到251.73万，短期内刷新了4月1日3号线开通首日创造的211.1万客运量历史纪录。根据客流分析，清明节小长假的出行客流是此次客运量刷新的主要因素。4月3日上午开始，与4月2日同期相比，南京地铁各条线路的进站客流均出现了不同程度的增幅，其中，线网进站客流增幅较大的车站为南京站、南京南站、大行宫等车站。按照以往惯例，小长假前一天的客运量通常会达到整个小长假期间的峰值。就此，南京地铁在4月3日按照既定方案调整了运力，并使用专用运行图，进入清明节大客流运输模式，确保南京地铁全线网安全度过了历史最高客运量的冲击。